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管道式紫外線殺菌器殺菌原理是利用紫外線能夠破壞微生物機體細目前國內水汙染嚴重，針對水資源匱乏的情況，紫外線殺菌器胞中的DNA(脫氧核糖核酸）或RNA(核糖核酸）的分子結構，造廣泛應用於水箱水泵配套、食品飲料加工、醫藥、化工等行業的純水、成生長性細胞死亡和（或）再生性細胞死亡，達到殺菌消毒的效果。高純水製備，自來水二次供水、水產養殖、泳池等行業。
低壓紫外燈管在波長為253.7nm處，殺菌效率高。但它隻是一直線輸出的單頻譜，波長範圍窄短；而中壓紫外線燈波長範圍寬廣，很多細菌都能殺滅，對於遊泳池這種低負荷的輕微汙染水體，殺菌效果十分明顯。
管道式紫外線殺菌器，溫度對殺菌效果影響
一般遊泳池的水溫是36~28℃或更高，高於一般消毒劑和消毒方式的作用評估溫度（一般自來水和汙水都比此溫度低）。低壓紫外線燈管發生效率受溫度的影響較大，而中壓紫外線燈管的發生效率基本不受溫度影響。
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